Alex Marti ve diğer hayvanat bahçesi hayvanları penguenlerin kırık bir uçağı yeniden bir araya getirmesiyle Madagaskardan kaçmanın yolunu bulur Afrika anavatanina adersin il nave boyunda yolculuk yapar orada kendi türlerinden ilk kez karşılaşırlar Afrika vahşi bir yer kanlı bir şehir olsa da Alex ve ekip merkez park evlerinden daha iyi mi diye merak eder