ویژگی کاراکتر کواکو، دانش‌آموز مدرسه میکرو-گراند که در حال یادگیری جادو است. روزی، در حالی که معلم جادو Ghana مشغول انجام مراسمی برای احضار ارواح درخت است، کواکو شکلاتی می‌یابد و می‌خورد که به طور عجیب ۲۰۰ سال عمر جادویی دارد. پس از خوردن شکلات مست می‌شود و به هم‌ریختگی منجر می‌شود. در این حین او در جادوی Ghana دخالت می‌کند و روح Hinano را فراری می‌دهد. او در بدن تماشاگر نمایش به خانه کواکو می‌آید و با او همراه می‌شود. قسمت‌های بعدی Trouble Chocolate داستان پیوسته‌ای ندارند بلکه این نمایش تمسخرآمیزی به دیگر انیمه‌ها است. دیالوگ دوبله‌شده در Trouble Chocolate اغلب با متن اصلی شباهت زیادی ندارد، برخلاف معمول ترجمه مستقیم گفتار که با هماهنگی لب‌ها مطابقت دارد.