این سریال یک سال قبل از رویدادهای سریال اصلی ماکروس اتفاق می‌افتد و روزهای پایانی جنگ بین سپهبدی سازمان ملل متحد و دسته‌های ضدِ سازمان ملل را روایت می‌کند. پس از اینکه توسط جدیدترین جنگنده ضدِ سازمان ملل شلیک می‌شود، خلبان باتجربه شین کدو به جزیره دورافتاده مایان می‌رسد جایی که فناوری تقریباً وجود ندارد. در حالی که شین برای بهبود زخم‌هایش در جزیره می‌ماند، آرامش جزیره با نبردی که شامل جدیدترین جنگنده سازمان ملل است نابود می‌شود — فِی-۰.