جستجوی شهر گمشده خدای میمون به دنبال کاوشگر استیو الکینز و تیمی از باستان‌شناسان، انسان‌شناسان، دانشمندان و فیلم‌سازان در این ماجرای واقعی است که آنها بر باران‌های سیل‌آسا، جنگل‌های انبوه، خزندگان سمی و مگس‌های حامل بیماری غلبه می‌کنند تا یکی از آخرین مکان‌های ناشناخته روی زمین را برای یافتن یک شهر مایا جستجو کنند. با استفاده از فناوری لیزر پیشرفته، آنها می‌توانند شهر پنهان شده در جنگل غیرقابل نفوذ را "ببینند" و با حمایت رئیس‌جمهور هندوراس و ارتش او، قادر به نجات شهر یافته شده از تخریب و غارت حتمی و کاوش و حفظ کشف خود هستند و شروع به حل معماهای شهر گمشده می‌کنند.