آلمان در پاییز به خودی خود داستانی ندارد؛ این فیلم ترکیبی از تصاویر مستند و صحنه‌های استاندارد سینمایی است که حال و هوای آلمان در اواخر دهه ۱۹۷۰ را به نمایش می‌گذارد. این فیلم به دوره دو ماهه در سال ۱۹۷۷ می‌پردازد که در آن یک تاجر ربوده و سپس توسط تروریست‌های چپ‌گرا به نام RAF (فرقه ارتش سرخ) به قتل رسید. این تاجر به منظور تأمین آزادی رهبران اصلی RAF، که به عنوان بادر-ماینهوف نیز شناخته می‌شوند، ربوده شده بود. زمانی که تلاش برای ربودن و تلاش برای هواپیما ربایی شکست خورد، سه رهبر برجسته RAF، آندریاس بادر، گودران انسلین و یان-کارل راسپه، در زندان خودکشی کردند. این موضوع به یک باور در جامعه چپ‌گرا تبدیل شده است که این سه نفر در واقع توسط دولت کشته شده‌اند.